164آنچه كه على قلى جديد الاسلام ملاحظه و نقد كرده، همين كتاب فليپ پادرى بوده است. وى از اطلاعات آن كتاب چنين به دست آورده كه اثر ياد شده در رد مير سيد احمد علوى است. اما اين‌كه خودش كتاب مير سيد احمد را ديده يا نه، آگاهى نداريم. على قلى، ضمن ترجمه و نقد سفر پيدايش تورات و نيز در بخش‌هايى از كتاب «هداية الضالّين» به نقد نوشته‌هاى فليپ پادرى پرداخته است.
على قلى، صرف نظر از هدفى كه براى نقد و ترجمۀ تورات داشته، از همان ابتدا بنا را بر آن گذاشته است تا به نقد مطالب فليپ كه در بارۀ «پيامبر و قرآن» بوده بپردازد و لذا مى‌گويد: «چون در ابتداى اين مدعا وعده كرده‌ايم تهمت‌هايى را كه فليپ ملعون، در آن عبارت او كه ترجمه كرده‌ايم، يك يك را به‌شماره در آورده، رد و باطل سازيم، مناسب است از براى آن‌كه خلاف وعده نشود به اين كار اقدام بورزيم.»
على قلى در بارۀ خودِ فليپ مى‌نويسد:
«اين فليپ. . . بعد از آن‌كه به اعتقاد خود، علم عربيت را تحصيل كرد، به روم رفت. ريم پاپاىِ زنديق او را استاد و معلم زبان عربى و رديه نويس به اسلام لقب داد و مبلغ عمده‌اى از اين جهت، براى او وظيفه قرار داد» . به نظر على قلى، هدف پاپ از تقويت فليپ و چاپ كتاب وى آن بوده است كه «به توسط مكر و افتراهاى پادرى فليپ مردود، تمام ايران و روم و هند بلكه ديار مغرب و اوزبكيه و غيره را اضلال نموده، همه را در زير فرمان» درآورد.
وى در جاى ديگرى از اين كتاب، ضمن اشاره به كارهايى كه نصارا بر ضدّ اسلام انجام داده‌اند، مى‌نويسد: «از آن جمله فليپ پادرىِ نامى، در ردى كه به دين اسلام، به زبان لاتين نوشته و در ميان نصارا منتشر كرده است، از براى آن‌كه نصارا رسالۀ او را مطالعه كرده، بر ضعف دين اسلام آگاه گردند و در اعتقادى كه به قوت تمام، به دين ثلاثه دارند سست و ضعيف نشوند» . و سپس اشاره به اقدام خود در نقد كتاب فليپ كرده، مى‌گويد: ما «در اينجا نقل مى‌كنم از براى آن‌كه هم عداوت و عناد آن ملعون و ساير نصارا نسبت به دين اسلام و اهل آن ثابت شود و هم از سستى خيال‌هاى پا در هواى او قوّت و حقيّت دين اسلام ظاهر و هويدا گردد» .
وى به‌طور معمول، از فصول و ابواب مختلف كتاب فليپ ياد كرده و مطالب را نقل و سپس نقد مى‌كند. براى نمونه در باره موردى مى‌نويسد:
«پادرى فليپ، در فصل اوّل باب دهم كتاب خود، كه به رد نبوّت و دين آن جناب