121بعضى حاكمان و واليان تعمير و بازسازى گرديد. بناى كنونى مرقد، كه ششمين و آخرين تجديد بناست و البته بعضى تغييرات و اصلاحات در آن داده شده، به دست شاه صفى صفوى (متوفى 1052ق) صورت گرفت.
1. نماى قبر شريف
روى قبر، صندوقى از جنس عالىترين چوب كه با عاج معرقكارى شده و بر آن آياتى از قرآن و اسماء جلاله نقش بسته، قرار دارد.
2. ضريح
صندوق مرقد را پنجرهاى نقرهاى كه با طلاى ناب اندود شده، در بر گرفته است.
3. روضه مقدسه
ضريح مرقد اميرمؤمنان (ع) در وسط روضه است؛ اتاقكى چهارگوش، آيينهكارى شده و منقوش به آياتى از قرآن. از روضه مقدس، چهار در به رواقها گشوده مىشود. دو در از طلا، مقابل رواق طلا و دو در ديگر از نقره در جهت شمال. در مقابل هر در، پنجرهاى بزرگ مُشرف بر رواق ديده مىشود.
4. گنبد
بر فراز روضة مقدس علوى، گنبدى بزرگ از طلا قرار دارد كه خود، نشانهاى است از ابداع هنرى و 7777 خشت طلاى خالص در آن بهكار رفته است. سطح داخلى گنبد، با كاشىهاى زيباى معرّق، نامهاى معصومين (عليهم السلام) ، آيات قرآن و اشعارى عربى در مدح امام على بن ابىطالب (ع) آراسته شده است.