173آل بويه افزود و حرم كاظمين را دو گنبده كرد و شاه اسماعيل صفوى آن دو گنبد را كاشى كارى كرد.
شاه اسماعيل صفوى قبه‌هاى ياد شده را با خشت‌هاى طلا آراست 1و آقا محمدخان قاجار پوشش طلاى فرسودۀ آن را تجديد و مرمت كرد 2و از پايين تا بالا آن را طلا كرد.اين دو گنبد در دو مترى هم واقع است و بر روى آن ها كتيبه و مقرنس ديده نمى‌شود.ارتفاع آن‌ها 14/5 متر و از پايين تا نوك 29 متر و مساحت قسمت پايين آن‌ها 29 متر است.تذهيب و تزيين محيط داخلى گنبد در دوران شاه اسماعيل انجام شده است.
و آينه كارى داخل گنبد نيز از ميرزا شفيع صدر اعظم است. 3
اكنون مرقد مطهر دو امام،چهار مناره دارد.نخستين بار معز الدوله ديلمى يك مناره برفراز قبر آنان ساخت كه در يك آتش سوزى آسيب ديد و سپس توسط ارسلان بساسيرى تجديد بنا شد. 4
مجد الملك براوستانى،وزير بركيارق،دو مناره ديگر براى حرم ساخت.اين مناره‌ها در دوران شاه صفى،جانشين شاه عباس،تجديد بنا و با كاشى‌هاى زيبا آراسته شد كه اكنون هم پا برجاست. 5آقا محمد خان قاجار اين مناره‌ها را با خشت‌هاى طلا آراست 6و تعداد آن‌ها را به چهار رساند.فتحعلى شاه نيز طلاهاى فرسودۀ آن‌ها را با طلاهاى جديد عوض كرد.پادشاهان عثمانى از جمله سلطان سليم نيز در ساخت يك مناره و ترميم برخى از آن ها نقش داشتند و كتيبه‌هايى از خود برجاى گذاشته‌اند.
اين چهار مناره در چهار سمت حرم ساخته شده و داراى پنج متر ارتفاع و چهار متر محيط است.ارتفاع آن‌ها در زمان‌هاى پيشين حدود نُه متر بود كه به مرور از ارتفاع آن كاسته‌اند. 7