163در 651 ق،در جريان حمله هولاكو به بغداد،كاظمين نيز از تخريب بى‌نصيب نماند و رو به ويرانى رفت.به ويژه مرقد امامان شيعه آسيب شديد ديد.چندى گذشت تا اين كه علاء الدين جوينى،حكم‌ران بغداد،به مرمت و بازسازى شهر و مقبرۀ امامان پرداخت و همه را بازسازى كرد. 1اندكى از اين بازسازى نگذشته بود كه رود دجله طغيان كرد و به بخش‌هايى از شهر،به ويژه حرم امامان شيعه،آسيب وارد ساخت و در 726 ق،سلطان ابوسعيد بهادرخان،از ايلخانان مغول،به ترميم و بازسازى شهر و حرم‌هاى مطهر همت گماشت.بعدها براى حفاظت شهر از طغيان دجله و نيز جلوگيرى از تهاجمات خارجى پيرامون شهر ديوار كشيدند.
ب-تاريخچه حرم كاظمين
به هنگام انتخاب بغداد به عنوان پايتخت در دورۀ خلافت منصور،در جوار اين شهر باغ‌هايى وجود داشت كه به شونيزيه معروف بود.منصور در 145 ق اين باغ را به عنوان مقبره خانوادگى خود انتخاب كرد و آن را«مقابر قريش»ناميد.نخستين كسى كه در اين قبرستان دفن شد جعفر فرزند منصور عباسى بود كه در 150 ق از دنيا رفت.در 179ق،امام موسى كاظم عليه السلام براساس دستور هارون،از مدينه به بغداد آمد و در آن شهر زندانى شد و سپس در 183 ق به دستور خليفه توسط زندان‌بانش،سندى بن شاهك، مسموم شد و به شهادت رسيد.ايشان را در همان مقابر قريش،مكانى كه خود قبل از آن خريده بود،به خاك سپردند. 2
امام كاظم عليه السلام چهارمين فردى بود كه در اين مقبره دفن مى‌شد.قبل از ايشان جعفر و سپس عيسى نوفلى در آن مكان به خاك سپرده شده بودند و سومين نفر،خليفه امين، فرزند هارون بود كه مادرش،زبيده خاتون،برقبر او بقعه‌اى بنا كرد.با نظر امام جواد عليه السلام و