36عبدالرحمان عتائقى حلّى نجفى»، در آخر كتاب «شرح الفصول الايلاقية»، اشاره كرده است كه سال آتش‌سوزى حرم مطهر، 755ه .ق بود كه در سال 760ه .ق بازسازى شد. 1
ابن‌عنبه نيز اشاره كرده است كه در آتش‌سوزى حرم اميرمؤمنان(ع) در سال 755ه .ق، قرآنى در سه جلد بزرگ كه گفته مى‌شود به خط اميرمؤمنان(ع) بود، در آتش سوخت. 2
پس از به قدرت رسيدن سلسله صفويه در ايران، شاه اسماعيل صفوى در سال 914ه .ق، وارد بغداد شد و پس از آن، به زيارت امام حسين(ع) در كربلا و اميرمؤمنان(ع) در نجف، مشرف شد. او هداياى نفيسى را به خزانه آستان علوى داد و حرم و رواق‌هاى آن را پر از فرش‌هاى ابريشمى كرد. 3
در سال 1047ه .ق، به دستور شاه صفى (حك: 1038-1052ه .ق)، نوه شاه عباس اول صفوى، حرم مطهر و صحن آن توسعه داده شد. براى اين منظور، به دستور شاه صفى، خانه‌هاى مجاور حرم مطهر، از دو سمت شرقى و جنوبى، خريدارى گرديد و به صحن ملحق شد و بدين ترتيب صحن آستان از سه سمت توسعه يافت. بناى فعلى آستان مقدس علوى با برخى تغييراتى كه در دوره‌هاى بعد ايجاد شد، مربوط به همين توسعه است. 4
(تصوير شماره 13 و 14)
در سال 1156ه .ق، هنگامى كه نادرشاه به زيارت آستان علوى مشرف شد، دستور داد كاشى‌هاى سبزرنگى را كه از دوره صفويه زينت‌بخش گنبد و گلدسته آستان بود، بردارند و به‌جاى آنها، از خشت‌هاى طلا، استفاده كنند. بدين ترتيب، گنبد حرم علوى كه تا پيش از اين، داراى پوشش كاشى‌كارى بود، طلاكارى گرديد. اين كار با استقبال شيعيان مواجه گشت. تعدادى از شاعران شيعه به فارسى و عربى و حتى تركى و هندى،