17شيخ معلمى كتابى با عنوان «طليعة التنكيل» نوشت و در اين كتاب مختصر تلاش كرد تا برخى مطالب كتاب «تأنيب الخطيب على ما ساقه في ترجمة ابى‌حنيفة من الأكاذيب» (اثر كوثرى) را اصلاح كند. كوثرى در پاسخ به آن، رساله‌اى با عنوان «الترحيب بنقد التأنيب» را به شيوه‌اى علمى و دقيق نگاشت. 1البته پس از آن، كتاب مختصر «طليعة التنكيل» ضخيم‌تر شد و در دو جلد به چاپ رسيد. در اين كتاب مطالب ناپسند و بدزبانى فراوان ديده مى‌شود. به نظر مى‌رسد اين سخنان از محقق معروف، شيخ معلمى باشد.
ايشان همچنين كتاب‌هاى مختلفي نوشت. در كنار آن بر كتاب‌هايى كه در صندوق‌خانه‌ها خاك مى‌خورد يا نسخه خطى آنها موجود بود، تعليقاتى نگاشت. برخى از اين تعليقه‌ها كوتاه و برخى مفصل بودند كه در مجموع، شصت مقدمه يا تعليقه از ايشان بر جاى مانده است. برخى از دانشمندان گرامى، اينها را در مجموعه‌اى مستقل گردآورى كرده‌اند.
تأليفات، مقدمه‌ها، تعليقه‌ها و مقاله‌هاى مرحوم كوثرى
تأليفات استاد به دو بخش اصلى تقسيم مى‌شود: تأليفات پيش از هجرت از آستانه وآنچه كه پس از مهاجرت نگاشته است.
بيشتر آنچه پيش از مهاجرت نوشته است، آثار خطى هستند. اما در بخش دوم آثار چنين نيست. از آثار بخش اول تنها از اثر «ارغام المريد»