72گروهها يافتن راه خروج از بنبست سياسى موجود و تعيين چگونگى رويارويى با رژيم بعث حاكم بر عراق بود. عضويت اعضاء در آن براساس مقبوليت، سابقه مبارزاتى و توانمندى اشخاص بود؛ نه براساس وابستگىهاى گروهى.
آيتالله محمدباقر حكيم در اين زمينه مىگويد:
تشكيل اين مجلس، زمانى رخ داد كه شهادت آيتالله محمدباقرصدر به دست رژيم حاكم عراق، خلأ بزرگى را در رهبرى مبارزات اسلامى عراق بهوجود آورد. ازاينرو جمعى از علما و شاگردان شهيد صدر و رهبران جنبش اسلامى عراق، براى جبران اين خلأ كوشيدند و با همكارى جمهورى اسلامى، بحثهاى گستردهاى صورت گرفت. در نتيجه، جمعيت علماى مجاهد عراق و دفتر انقلاب اسلامى تأسيس شد و سپس تلفيق و توسعه همه اين مؤسسات در مجلس اعلا اتفاق افتاد. 1
رياست اين مجلس را بهترتيب سيد محمود هاشمى 2، سيد باقر مهرى 3، سيد محمدباقر حكيم (فرزند آيتالله العظمى سيد محسن حكيم كه در تيرماه 1382ه.ق در نجف به شهادت رسيد) و سيد عبدالعزيز حكيم (برادر سيد محمدباقر حكيم) برعهده داشتند. در حال حاضر سيد عمار حكيم (فرزند سيد عبدالعزيز حكيم) رياست اين مجلس را برعهده دارد. برخى از مسئولان و اعضاى شوراى مركزى نخستين دوره مجلس