57هرات پس از انقراض غوريان، به حكومت رسيدند. ركنالدين، حاكم هرات، با اظهار اطاعت از چنگيزخان مغول، قلمروى خود را حفظ كرد و امنيت مردم هرات را تضمين نمود. وى در سال 643 ه.ق مرد و نوه دخترى خويش، شمسالدين محمدبنابىكرت، ملقب به كرت را به جانشينى برگزيد. وى اولين امير خاندان آلكرت بود.
شمسالدين محمد (767-643 ه.ق) با سركردگان مغول، به «سند» يورش برد و حاكمان «لاهور» و «مولتان» را مطيع مغولان كرد. ازاينرو مغولان، به پاس اين خوشخدمتى، وى را حاكم لاهور و بخشى از افغانستان، سيستان تا كنار سيحون و ساحل سند كرد. با درگذشت وى، آباقاخان، فرزند او را به نام ركنالدين، حاكم هرات كرد. 1
ملك معزالدين حسين (771-732 ه.ق) از مشهورترين امراى آلكرت بود كه بعد از مرگ ابوسعيد، حكومت خود را استحكام و استقلال بخشيد. وى با پيروزى بر سربداران، به مركزيت سبزوار، «حافظ اسلام» لقب گرفت. 2 اواخر دوران وى با به قدرت رسيدن تيمور در ماورءالنهر مصادف شد. تيمور از معزالدين حسين كه در جوانى اسيرش بود و به شفاعت فرزند ملك رهايى يافته بود، خواست كه از وى پيروى كند، ملك، ابتدا با تيموريان جنگيد، اما از عهده آنها برنيامد. ازاينرو درخواست صلح كرد و هرات به تصرف تيمور درآمد. 3 اما مدتى بعد سلاطين آلكرت طغيان كردند و نابود شدند. 4
خاندان آلكرت، حنفىمذهب بودند و حمايت آنان از تسنن، مانع رشد مذهب تشيع كه مروّج آن سربداران بودند، مىشد. 5