49اتاق شمارۀ 21: آرامگاه شيخ حسين بن عبدالرحيم نايينى (متوفى 1355 ه-. ق) و سيد محمد بن ميرقاسم فشاركى (متوفى 1313 ه-. ق)، سيد اسماعيل بن رضى شيرازى، شيخ محمد غلام بن غلام على تسترى و شيخ موسى بن محمد خوانسارى
در ايوان اتاق، آرامگاه سيد على اصغر بن محمد تقى شهرستانى
اتاق شمارۀ 22: آرامگاه سيد حسين بن محمود قمى (متوفى 1366 ه-. ق)، شيخ فتح الله اصفهانى (شيخ شريعه) (متوفى 1339 ه-. ق)، شيخ باقر بن محمد مهدى زنجانى (متوفى 1394 ه-. ق)، سيد على بن محمد تقى تبريزى، شيخ ابوالقاسم بن محمد تقى اوردبادى و در ايوان اطاق آرامگاه شيخ على اكبر بن هاشم خوئى
اتاق شمارۀ 23: آرامگاه شيخ محمد على بن ابى القاسم اوردبادى (متوفى 1308 ه-. ق)، سيد احمد بن رضى مستنبط (متوفى 1400 ه-. ق)
اتاق شمارۀ 24: آرامگاه سيد حسن بن عبدالله طالقانى (متوفى 1307 ه-. ق)، سيد عباس بن حسين طالقانى (متوفى 1308 ه-. ق)، سيد احمد بن حسين (طالقانى (متوفى 1337 ه-. ق) و سيد عبدالرسول بن مشكور طالقانى (متوفى 1394 ه-. ق)
اتاق شمارۀ 26: آرامگاه سيد ابوالحسن بن محمد اصفهانى (متوفى 1356 ه-. ق)، سيد ميربادكوبى (متوفى 1359 ه-. ق)، سيد حسن بن آقا بزرگ بجنوردى (متوفى 1405 ه-. ق)، شيخ حبيب الله بن محمد على رشتى و شيخ محمد كاظم بن حسين خراسانى معروف به آخوند خراسانى صاحب كفايت الاصول
اتاق شمارۀ 29: آرامگاه سيد ابوالقاسم بن محمدرضا تبريزى، شيخ محمد على بن محمد حسن خونسارى و سيد عزيزالله بن حسين دركنى
اتاق شمارۀ 31: آرامگاه آيت الله العظمى سيد ابوالقاسم بن على اكبر خوئى (متوفى 1413 ه-. ق) همراه با فرزندان و سيد نصرالله بن رضى مستنبط (متوفى 1400 ه-. ق) داماد آيت الله خوئى
اتاق شمارۀ 46: آرامگاه سيد محمد بن محمد باقر فيروزآبادى و سيد هادى بن ابى الحسن نقوى
اتاق شمارۀ 47: آرامگاه سيد محمد كاظم بن عبدالعظيم يزدى (متوفى 1337 ه-. ق) صاحب عروة الوثقى
اتاق شمارۀ 48: آرامگاه سيد عبدالحسين بن يوسف شرف الدين صاحب المراجعات (متوفى 1377 ه-. ق)
اتاق شمارۀ 49: آرامگاه سيد عبدالغفار بن يوسف مازندرانى
اتاق شمارۀ 52: آرامگاه سيد حسين بن اسماعيل شاهرودى و سيد عزيز الله بن اسدالله تهرانى
اتاق شمارۀ 53: آرامگاه شيخ عبدالكريم بن محمد رضا زنجانى (متوفى 1388 ه-. ق)
گلدستۀ سمت درب باب طوسى: سمت راست گلدسته آرامگاه شيخ محمد حسين بن محمد حسن اصفهانى كمپانى (متوفى 1361 ه-. ق) استاد برجستۀ حوزۀ نجف، شهيد آيت الله سيد مصطفى بن روح الله خمينى (متوفى 1379 ه-. ق) و در سمت چپ گلدسته آرامگاه علامه حلى حسن بن يوسف بن مطهر (متوفى 726 ه-. ق)
گلدستۀ سمت درب باب قبله: سمت راست گلدسته آرامگاه مقدس اردبيلى احمد بن محمد (متوفى 992 ه-. ق)
ايوان علما: آرامگاه شيخ محمد مهدى بن ابى ذر نراقى صاحب جامع السعادات (متوفى 1209 ه-. ق) و شيخ احمد بن محمد مهدى نراقى، صاحب مستند الشيعه فى علم الشريعه، سيد عبدالباقى بن محمد حسين خاتون آبادى و شيخ محمدباقر بن محمد باقر هزار جريبى