71نيز در سال 941ه ق قبل از بازگشت به قسطنطنيه عازم زيارت نجف وكربلا شد.
در سال 1032ه . ق در دوران سلطنت سلطان سليم عثمانى، ترك‌ها موفق به محاصرۀ نجف شدند. اما به علت مقاومت دليرانۀ اهالى شهر موفق به فتح شهر نشدند.
در دوران سلطنت >سلطان مراد< عثمانى‌ها به بغداد حمله كردند، نجف نيز در معرض حملات آنان قرار گرفت اما لشكريان شاه عباس اول كه در شهر مستقر بودند به دفاع از شهر پرداختند.
در سال1040ه . ق فرمانده عثمانى >كنج عثمان< با موفقيت شهرهاى نجف وكربلا را فتح كرد.
در سال 1041ه . ق سردار عثمانى >خسرو پاشا< كه موفق نشده بود شهر بغداد را از چنگ لشكريان صفوى خارج كند، مجدداً به شهر نجف حمله كرده وآن را دوباره فتح نمود.
در سال 1109ه . ق رودخانۀ فرات طغيان كرد و شهر نجف و زمين هاى پيرامون آن غرق شد و در همين حين برخى از رؤساى قبايل دست به چپاول شهر زدند.
در قرن دهم و يازدهم هجرى اهالى شهر به بيمارى هاى واگيردار بسيارى مبتلا شدند كه منجر به از بين رفتن اهالى و متوقف شدن رشد و توسعه شهر شد.