168حاكمان و اميران شيعى بغداد،در جريان بازسازى حرم دو صندوق جديد روى قبرها گذارد و در 629 ق،المستنصر آخرين خليفه عباسى يك صندوق زيبا بر قبر امام جواد نصب كرد.اين دو صندوق تا عصر سلطان اويس جلايرى،يعنى 769 ق،باقى بود و در آن سال به سبب فرسودگى و آسيب ديدگى،دو صندوق نو و زيبا با خاتم كارى زيبا جاى گزين آن‌ها شد.
شاه اسماعيل صفوى در قرن دهم هجرى(926 ق)دو صندوق بسيار زيبا و خاتم كارى شده بر روى قبر دو امام نصب كرد.صندوق روى قبر امام جواد عليه السلام،كه امروزه هم چنان موجود است،از شاهكارهاى هنرى آن عصر است و به لحاظ ريز نقش و پركار بودن آن،از همه صندوق‌هاى نصب شده بر قبرهاى عتبات زيباتر و جذاب‌تر است و شاهكار و زيبايى آن را تنها مى‌توان با چشم مسلح ديد.قسمت‌ها و تكه‌هاى بسيار ريز عاج،كه يك دهم ميلى متر است،در داخل چوب هاى صنعتى و آبنوس كار شده و گل‌هاى منبّت از عاج با شاخه‌هاى گل نيم ميلى مترى از جلوه‌ها و شاهكارهاى هنر اسلامى و ايرانى است كه همۀ هنرمندان را به حيرت واداشته است.اين صندوق 2/5 متر طول،1/83 متر عرض و 1/5 متر ارتفاع دارد و مساحت آن بيش از 182000 سانتى متر مربع است. 1
صندوق امروزين مزار مطهر امام موسى كاظم،كه از عصر صفوى هم چنان باقى مانده،و توسط استاد صنيع خاتم ترميم شده است.از لحاظ هنرى و ريزكارى و پرنقشى به پاى صندوق قبر امام جواد عليه السلام نمى‌رسد.اين صندوق بيش از 152000 سانتى متر مربع مساحت دارد و از صندوق قبر امام جواد كوچك‌تر است.كتيبه‌هايى دارد كه در 1324 ق شمسى كارى شده است. 2ناصرالدين شاه آن صندوق‌ها را ديده و اظهار مى‌دارد كه با نقره تزيين شده است. 3