9پس از شكست انقلابيون و سلطه انگليسى‌ها بر عراق، كميسر عالى انگليس در بغداد تسليم هفده نفر از سران انقلاب، كه يكى از آن‌ها مرحوم آيةاللّٰه كاشانى بود را، از شروط صلح با عراق تعيين كرد و حكم اعدام ايشان غياباً صادر گرديد. از اين‌رو، وى شبانه به‌سوى ايران حركت و در 30 بهمن 1299ه ش، سه روز قبل از كودتاى رضاخان وارد تهران شد و مورد احترام و تجليل مردم و مسؤولان وقت قرار گرفت.
با شكل‌گيرى حكومت رضاخان و اجراى توطئه‌هاى پى‌درپى ضد دينى، از جمله خلع لباس روحانيون، ماجراى كشف حجاب، ديدار او با آتاتورك در تركيه و... مرحوم كاشانى بار ديگر مبارزات خود را آغاز و عليه رژيم پهلوى وارد عمل شد. و در نتيجه توانست از خلع لباس بسيارى از روحانيون جلوگيرى كند.
ايشان از جمله شخصيّت‌هايى بود كه براى روحانيون مجوز داشتن لباس روحانيت صادر مى‌كرد و بر اساس همين اختيارى كه داشت، بسيارى از علما و روحانيون محترم تهران و شهرستان‌ها موفق شدند لباس روحانيت خود را حفظ كنند.
آية اللّٰه كاشانى همچنين در مقابلۀ با پديدۀ كشف حجاب برخوردى جدّى داشت و توانست از اجراى بسيارى از توطئه‌ها در اين زمينه جلوگيرى نمايد.
پس از شهريور 1320 و عزل رضاخان از سلطنت، دولت انگليس از طريق نخست‌وزير وقت، فشار را بر ايشان بيشتر كرده و سرانجام در 27 خرداد سال 1323ه ، وى را در گلاب‌دره شميران دستگير و بازداشت كردند و پس از يكسال زندگى مخفى، چهارده ماه نيز در زندان‌هاى نيروهاى