99كودتاى ژنرال سوارالذهب در 1985 و تشكيل دولت انتقالى توسط وى تا 1986، حاكميت احزاب (حزب امت) 1986 - 1989 و كودتاى نجات ملى انقاذ (جنبش اسلامى سودان) توسط ژنرال عمر حسن احمد البشير و بهقدرت رسيدن نظاميان در 30 ژوئن 1989 و ادارۀ شورايى كشور تا سال 1993م و منصوب شدن ژنرال عمر البشير از سوى شوراى نجات ملى بهعنوان رييس جمهور در سال 1993م؛ كه ادامۀ رياست جمهورى البشير يكبار در سال 1996م و بار ديگر در سال 2000م با برگزارى انتخابات رياستجمهورى و كسب اكثريت آراء ادامه يافت. بهدنبال امضاى موافقتنامه صلح با جنوب، طرفين صلح توافق كردند تا البشير تا پايان دوره ششسالۀ انتقالى تا سال 2009م، رياستجمهورى را همچنان برعهده داشته باشد.
با نگاهى به دورههاى حاكميت درمىيابيم كه قدرت در سودان همواره ميان نظاميان و احزاب سياسى در گردش بوده است و اين پديده، ويژگى تاريخ سياسى سودان را تشكيل مىدهد. كودتاهاى صورتگرفته در اين كشور، معمولاً بدون خونريزى و يا بازداشتهاى گسترده، همراه بوده است.
نظام سياسى و ساختار حاكميت
براساس موافقتنامۀ صلح جنوب معروف به موافقتنامۀ «نيواشا» كه ميان حزب كنگرۀ ملى بهعنوان حزب حاكم و جنبش مردمى آزادىبخش سودان ( SPLA ) بهرهبرى جان گارانگ در نهم ژانويه 2005م به امضا رسيد، حاكميت در سودان با اختصاص 52 درصد به حزب موتمر ملى