1012005م رسيده است؛ كشور در دو سطح ايالتى و فدرالى با 26 ايالت در دو بخش شمال و جنوب اداره مىشود. بخش جنوب با 10 ايالت، داراى حكومت خودمختار فدرالى و نيز قانون اساسى مستقل است. هر ايالت داراى يك والى، چندين وزير و يك مجلس مستقل است. والى و وزراى ايالتى در شمال از سوى رييسجمهور و در جنوب از سوى رييس دولت جنوب كه معاون اول رييس جمهور است، با مشورت رييس جمهور برگزيده مىشود. در حال حاضر بودجۀ جنوب توسط وزارت دارايى شمال، براساس پروتكل تقسيم ثروت تعيين مىشود. شعبهاى از بانك مركزى سودان در جنوب راهاندازى شده كه با سيستم بانكدارى اسلامى شمال متفاوت مىباشد. قرار است واحد پول جديد هم در كشور رايج گردد.
پارلمان
براساس قانون اساسى دوره انتقالى، اين كشور داراى يك مجلس ملى با 450 كرسى است، كه اعضاى آن براساس سهميهبندى موافقتنامه صلح در بخش حاكميت از ميان حزب حاكم، جنبش جنوب و ديگر احزاب سياسى معرفى و تشكيل شده است. مدت دورۀ مجلس فعلى تا زمان برگزارى انتخابات آزاد پارلمانى دورۀ انتقالى است كه زمان برگزارى آن تاكنون مشخص نشده است. آقاى احمد ابراهيم الطاهر رياست مجلس ملى را برعهده دارد.
احزاب مخالف دولت سودان تماماً از انجام صلح جنوب كه به 21 سال جنگ خانمانسوز داخلى خاتمه داد، استقبال كردند، اما در مورد برخى