16مقبره شيخ طوسى - اعلى الله مقامه - با بعضى از علما، نزديك به صحن سمت درِ طوسى و متصل به در طوسى قرار دارد.

هنگام وارد شدن به صحن مقدس، دست چپ، مقبره مرحوم حجت‌الاسلام حاجى ميرزا محمدحسن شيرازى - اعلى الله مقامه - قرار دارد و در سمت بالاسر (دالان) مرحوم شيخ جعفر شوشترى با بعضى از علما مدفون هستند.

مقصود چهارم: در احوالات كربلاى معلى

مؤلف اولين بنايى كه بر مرقد مطهر امام حسين(ع) بعد از چندين بار تخريب قبر مطهر در سنه 247ق را نام مى‌برد، بنايى است كه منتصر، پسر متوكل، براى قبر مطهر درست كرده است. اين بنا كوچك بود و بعدها در دوره آل بويه، بناى وسيع و مرتفعى درست شد. تعميرات و تذهيب قبه، براى زمان آقا محمدخان قاجار است.

قبور علماى مدفون در حرم

مرحوم آقا باقر بهبهانى و آقا سيدعلى بحرالعلوم - اعلى الله مقامهما - در رواق سمت مشرق، مقابل كفشكن مدفون‌اند. آقا ميرزا صالح عرب، مشهور به داماد كه از اولاد مرحوم سيدعلى‌خان كبير بود، نزديك به صندوق مدفون است. آقا سيدمهدى شهرستانى و حاجى ميرزاحسين شهرستانى مرعشى - اعلى الله مقامهما - در رواق پيش‌رو مدفون‌اند. مرحوم شيخ عبدالحسين شيخ العراقين در درب سلطانى مدفون است. آقا شيخ مهدى خلف هم در همان سمت مدفون است.