271كاشيكارى نموده و با آيات قرآنى و نوشتههاى تاريخى مزين كنند و بجاى دوگلدستۀ موجود چهارگلدسته ساخته شود و مسجد بزرگى در سمت شمالى حرم ساخته شود كه اين مسجد بعدها به نام >مسجد صفوى< معروف شد و همچنين دستور داد تا حرم مطهر را فرش نموده و چلچراغهايى درآن نصب شود و خدام و محافظين و اذان گويانى برآن گماشت. برخى از آثار صفوى تا روزگار ما باقى مانده است.
در روز24 جمادى الاول سال 941ه ق سلطان عثمانى >سليمان قانونى< وارد شهر بغداد شد. وى در روز 28 جمادى به بازديد اماكن زيارتى عراق دركاظمين وكربلا و نجف پرداخت و هنگام زيارت حرم مطهركاظمين حقوقى را براى خدام حرم در نظرگرفت و سپس دستور داد تا بناى حرم و مسجد را كه شاه اسماعيل صفوى آغازكرده بود، ادامه دهند.
در سال 1032ه ق شاه عباس كبير دوباره بغداد را تصرف كرد و به زيارت مرقد مطهركاظمين رفت و دستور داد كه آثار ناشى از جنگ و اهمال را تعميركنند و ضريح بزرگى از فولاد بسازند وآن را روى دو صندوق موجود بر قبرها نهاده تا قبور مطهر هنگام درگيرى و غارت و جنگ آسيب نبينند، اما بعلت بدى روابط بين ايران و تركيه، ضريح مذكور عاقبت در سال 1115ه ق به كاظمين رسيد و نصب گرديد.
در سال 1042ه ق سيلاب شهر بغداد را فراگرفت و ديوارهاى حرم را سست كرد، پس شاه صفى به >قزاق خان< اميرالامراء سابق شيروان دستور داد تا خرابى ناشى از سيل را تعمير و بازسازى كند.
در سال 1045ه ق شاه صفى پسر شاه عباس كبير بازسازىهايى در حرم مطهركاظمين انجام داد وى دستور داد تا گلدستههاى حرم مطهركاظمين و جاهاى ديگرى از صحن شريف بازسازى و تعمير شود.