108شيخ مرتضى انصارى 1 : در سمت غرب راهرو و دالان باب القبله و درون اتاقى دفن است.
ميرزاى نائينى 2 : كه مدفون در دومين مقبره پيش از زاويۀ جنوبى است.
آخوند خراسانى 3 : در مقبرۀ جنوبى واقع در دالان باب الذهب قرار دارد. نزديك او مدفن فقيه مشهور ميرزا حبيب الله رشتى و سيد ابوالحسن اصفهانى واقع است.
آيت الله بهبهانى: وى از رهبران مشروطيت بود كه به دست مخالفان و عوامل بيگانه ترور شد. قبر او در دومين مقبره پس از دروازه باب السوق، به سمت شمال قرار گرفته است.
علاوه بر بزرگان فوق الذكر كه داراى مقابر مشهورى هستند، در صحن و حجره‌هاى اطراف آن نيز گروه زيادى از شخصيتهاى دينى مدفونند كه برخى از آنان عبارتند از: آيات عظام سيد محمد سعيد حبوبى، شربيانى، شيخ محمد حسن