12مشهد، در دارالحفاظ حرم حضرت رضا عليه السلام مدفون است. تاريخ وفات او در سنگ قبرش، دوم جمادى‌الثانيه ذكر شده، در صورتى كه گفتۀ اعتمادالسلطنه (دوم جمادى‌الاولى) بايد درست‌تر باشد. در اين سال، پيش از فوت خود به حكومت خراسان تعيين شده بود و قصد عزيمت داشت كه ناگهان در سن 67 سالگى فوت نمود.

محمدحسن‌خان اعتمادالسلطنه در يادداشت‌هاى روزانۀ خود (دوشنبه دوم جمادى‌الاولى 1300 ق.) مى‌نويسد: «حسام‌السلطنه عموى شاه، با دو سه كرور دولت، امروز شش ساعت به غروب مانده مرحوم شد. اين چند روزه حاكم خراسان شده بود، بيست و پنج‌هزار تومان پيشكش داده بود. امروز ساعت ديده بودند كه به طرف حكومت برود، به آن دنيا رفت!» ... سلطان مراد ميرزا در اواخر زمان حيات پدر خويش حاكم ارسباران (قراجه‌داغ) بود. در سال 1253 ق.، هنگام عزيمت محمد شاه به سمت هرات، براى اينكه مبادا در صفحات بختيارى به تحريك بيگانگان اغتشاشاتى روى دهد، سلطان مراد ميرزا با شش‌هزار نفر به چمن‌گندمان مأمور شد. در سال 1266 ق. پس از شكست و اعلام سالار و فتوحات نمايان در خراسان، به لقب حسام‌السلطنه ملقب گرديد.

سلطان مراد ميرزا در سال 1264 ق. بر حسب انتخاب ميرزاتقى‌خان اميركبير از تهران براى قلع و قمع سالار به خراسان مأموريت يافت و در سال 1265 ه‍ .ق. پس از احضار حمزه ميرزا (حشمت‌الدوله) برادرش، سلطان مراد ميرزا به جاى او والى خراسان شد و در سال 1266 پس از اعدام حسن‌خان سالار در حكومت خود كاملاً مستقل گرديد ...

حكومت وى تا سال 1270 ه‍ .ق. طول كشيد و در اين سال از حكومت خراسان معزول و به جاى او فريدون ميرزا فرمانفرما برادر اعيانيش استاندار خراسان شد فريدون ميرزا پس از دو سال و اندى حكمرانى در خراسان در سال 1272 ق. در مشهد درگذشت و حسام‌السلطنه در اين سال براى بار دوم استاندار خراسان گرديد و حكومتش تا سال 1275 ق. ادامه داشت. از طرفى چون اغتشاشات و بى‌نظمى‌هايى در هرات روى داده بود و از طرف ديگر امير دوست محمدخان با قرار قبلى با انگليسى‌ها و به تحريك آنها قصد داشت كه هرات را هم ضميمۀ مستملكات خود بنمايد، به اين جهات، از طرف دولت، به حسام‌السلطنه والى خراسان امر شد كه به هرات رفته آنجا را تصرف نمايد. حسام‌السلطنه ابتدا سام‌خان رئيس