63سيد بن طاووس، از عالمان پركار بود و آثار گوناگونى در كلام، اخلاق، ادعيه، رجال، فقه و حديث، از وى به‌جاى مانده است. بيشتر اين آثار، بارها چاپ و برخى نيز به فارسى، ترجمه شده است. برخى از اين آثار مهم ايشان، عبارت‌اند از: الاقبال لصالح الاعمال، امان الاخطار في وظايف الاسفار، جمال الاسبوع بكمال العمل المشروع، الدروع الواقية من الاخطار فيما يعمل كل شهر علي التكرار، الطرائف في معرفة مذاهب الطوائف، كشف المحجة لثمرة المهجة، المجتني في ادعيه المجتبي، محاسبة النفس، مصباح الشريعة، مضمار السبق، الملاحم والفتن، اللهوف علي قتلي الطفوف، مُهج الدعوات ومنهج العبادات، اليقين باختصاص اميرالمؤمنين بإمرة المؤمنين، غياث سلطان الوري لسكّان الثري، فرج المهموم في تاريخ علماء النجوم، فتح الابواب بين ذوي‌الالباب وبين رب الارباب، فلاح السائل ونجاح المسائل، الزام النواصب بإمامة علي بن ابي‌طالب، ربيع الشيعه، مصباح الزائر، الحجة، منتخبات اسرار الصلوة، الطرف من الانباء والمناقب. تعدادى از علماى شيعه، از جمله برادرزاده‌اش عبدالكريم بن طاووس، علامه حلى و پدر وى، نزد سيد بن طاووس، شاگردى كرده و از وى، اجازه روايت گرفته‌اند. 1
به گزارش مؤلف كتاب الحوادث الجامعه، سيد بن طاووس در سال 664ه .ق، در سن 73 سالگى، درگذشت و پيكرش به حرم مطهر امام على(ع) انتقال يافته و در آنجا، به خاك سپرده شد. 2 (مرقد سيد رضى‌الدين على بن طاووس تصوير شماره 14)
افزون‌بر اين گزارش تاريخى معتبر كه از يك نويسنده معاصر سيد بن طاووس است، او خود در يكى از آثارش، اشاره كرده است كه در زمان حيات خود، محل قبر خود را كنار جدّش، اميرمؤمنان على(ع)، تعيين كرده است تا پس از وفات، در آنجا به خاك سپرده شود. سخن وى در اين‌باره، چنين است: «كنت مضيت بنفسي واشرت إلي من حفر لي قبراً كما اخترته في جوار جدّي ومولاي علي بن ابي‌طالب متضيفاً ومستجيراً ووافداً وسائلاً