27ساخته بود تا پس از مرگ، او را در آنجا دفن كنند. او در سال 630ه .ق، در اربل، از دنيا رفت و به‌طور موقت، در قلعه اين شهر، به خاك سپرده شد. سپس در سال 631ه .ق، جنازه‌اش را بنابر وصيت، با كاروان حجاج، به سوى مكه روانه كردند. اما به علت خشكسالى شديد در آن سال، كاروان موفق به تكميل و ادامه مسير تا حجاز نشدند و ناچار به كوفه بازگشتند و جنازه كوكبرى را نزديك قبر مطهر امام على(ع) در نجف اشرف، به خاك سپردند. ¹

با توجه به تصريح مورخان، مبنى بر دفن وى در آستان مقدس علوى در نجف اشرف، نمى‌توان انتساب قبرى را به وى در اربيل پذيرفت. با اين حال، مى‌توان به يقين گفت كه مقبره منسوب به وى در اربيل، در واقع، قبر پدرش زين‌الدين على كوچك است كه به گفته ابن خلّكان، در مقبره اختصاصى خود، كنار مسجد جامع اربل، به خاك سپرده شد. ²

به هرحال، امروزه اين مقبره، به زيارتگاه مردم اربيل تبديل شده و شايد به علت اهميت مظفرالدين كوكبرى در تاريخ اين شهر و نيز نقش وى در پيدايش مراسم جشن سالروز ولادت پيامبر(ص)، به اين شخصيت، انتساب يافته است. گفتنى است برخى از عوام مردم، به‌ويژه زنان، هنگام زيارت اين قبر، شفاى بيمارى‌ها و قضاى حوايج خود را از آن، طلب مى‌كنند. ³