311به گسترش مذهب تشيع كمك كند و به همين دليل، شعرى در مدح خليفه مستعصم سرود و نزد ابنعلقمى، وزير خليفه فرستاد تا مقدمات حضور وى را فراهم كند. اما وزير كه پس از باخبر شدن از قصد خواجه، حضور وى را در بغداد مناسب ندانست، به محتشم قهستان سفارش كرد تا خواجه را نزد خود نگهدارد و اين باعث شد كه وى تا حمله هلاكو، نزد اسماعيليان بماند. 1
او در اين فرصت، كتابهاى زيادى، از جمله كتاب «اخلاق ناصرى» را به خواهش ناصرالدين، با استفاده از كتاب «طهارة الاعراق» ابنمسكويه، تأليف كرد و اخلاق ناصرى ناميد. زمانى كه علاءالدين محمد، رهبر اسماعيليان ايران از حضور خواجه در قهستان باخبر شد، وى را به قلعه الموت دعوت كرد و خواجه تا سقوط اين قلعه به دست هلاكو، نواده چنگيز، نزد اسماعيليان ماند. برخى گزارشها، اقامت خواجه نزد اسماعيليان را به اجبار و مانند يك زندانى مىدانند. 2
خواجه پس از سقوط الموت، به خدمت مغولان درآمد و تلاش كرد بر آنان، تأثير گذارد. او كنار رصدخانه مراغه كه در سال 657ه .ق، پس از دوازده سال بنا شد، كتابخانهاى بزرگ بنا كرد و كتابهاى تاراج شده از بغداد و شام و شمال عراق را در آن، جاى داد 3 كه عددش به بيش از چهارصد هزار جلد مىرسيد 4 و با اين كار وى، اين ميراث عظيم، از نابودى نجات يافت.
او جان بسيارى از دانشمندان، را به بهانه كار براى رصدخانه مراغه كه مورد علاقه و توجه هلاكو بود، حفظ كرد و از مرگ نجات داد. از جمله وظايف خواجه در دربار هلاكو، اداره موقوفات مختلف و صرف درآمد آن در عمران و آبادانى و تأسيس و گسترش