67منبت كه از صندوق منبت روى قبر باقى مانده و كتيبه‌اى كه با تاريخ 999ه .ق موجود است، بنا و الحاقات جانبى آن متعلق به دوران صفوى است.
تعمير اين بقعه به شهادت سبك بنا و اخبار به دست آمده از محل ثلث بانوى نيكو كار صفوى، شاه بيگم دختر شاه اسماعيل صفوى است كه در سال 969ه .ق وفات يافت و جسد او را حسب و صيتش از قزوين به قم نقل داده و در جوار حضرت معصومه دخت امام موسى كاظم(ع) به خاك سپردند. اين بنا در سال 970ه .ق از سوى برادر و وصى او شاه طهماسب صفوى ساخته شد.
قاعده بقعه از خارج به صورت هشت ضلعى مختلف الاضلاع با مصالح سنگ و گچ است كه هنگام تعمير، در صورت آن تغييراتى داده شده است. بنا از داخل به شكل مربع متساوى به عرض پنج و ارتفاع هشت متر با پوشش سيمانى و جدار رنگى فاقد تزيينات هنرى است. در هر ضلع آن، شاه‌نشينى به عرض دو و پنجاه سانتى متر تعبيه شده كه از آن، درى به خارج گشوده مى‌شود و در جلوى هر درى تالارى قرار دارد. به جز درِ جنوبى كه به كوه محدود مى‌شود، الباقى درها بسته شده است.
در چهار گوشه بقعه نيم‌طاقى بالا آورده و طرح بنا را به هشت ضلعى و سپس با كمك رسمى‌بندى به فلكه‌اى تبديل كرده و پاطاق پوشش عرق چينى را بر آن زده‌اند. بر فراز بقعه،